Ақпарат

Қысқы_2021_Bis2A_Facciotti_Reading_21 - Биология

Қысқы_2021_Bis2A_Facciotti_Reading_21 - Биология


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

2020_SS1_Bis2a_Facciotti_Reading_21 байланысты оқу мақсаттары

  • Орталық догманың негізгі компоненттерін және олардың арасындағы байланыстарды, соның ішінде репликация, транскрипция, трансляция, кері транскрипция процестерін және әртүрлі мүмкін болатын өнімдердің (яғни, мРНҚ, тРНҚ, рРНҚ, ферменттер, құрылымдық белоктар, репликацияланған хромосомалар) ықтимал тағдырларын сипаттаңыз. т.б.).
  • РНҚ құрылымдарын модельдейтін иллюстрациялар жасаңыз. Бұл мультфильм үлгілерін қамтитын мәліметтер мен абстракцияның бірнеше деңгейін қамтуы керек:
    • а. үш нуклеотид және олардың фосфодиэфирлік байланыстары.
    • б. мРНҚ мен тРНҚ-ның кішірейтілген көрінісі.

  • Геномдық аймақтың абстракцияланған үлгісін ескере отырып, гендердің, промоторлардың және ДНҚ тізбектерінің дерексіз көріністері ретінде сызықтық геном координатасында сызылған геометриялық нысандар ретінде ұсынылған басқа да функционалдық элементтердің көріністерін дұрыс түсіндіріңіз.
  • Транскрипциялық бірліктің құрылымдық элементтерінің әрқайсысының рөлдерін талқылау үшін транскрипциялық бірліктің үлгісін пайдаланыңыз. Транскрипцияланғандарды, аударуға болатындарды және басқа рөлдерге қызмет ететіндерді анықтаңыз.
  • динамикалық моделін (ауызша, сызба және т.б.) жасаңыз процесс реагенттерді, өнімдерді, ферменттерді, транскрипцияның өтуі үшін қажетті ДНҚ-дағы учаскелерді қамтитын транскрипция және бұл компоненттердің өзара әрекеттесуі процесс барысында әр түрлі уақытта ДНҚ үлгісімен.
  • Эукариот генінің транскрипттері трансляциядан бұрын қалай өңделетінін және оның функционалды әртүрлілікті тудыру үшін маңызын сипаттаңыз.

Генетикалық ақпарат ағыны

Бактерияларда, археяларда және эукариоттарда ДНҚ-ның негізгі рөлі - бұл ағзаны құруға қажетті нұсқаулар жинағын кодтайтын тұқым қуалайтын ақпаратты сақтау. Химиялық құрамын (геномдағы нуклеотидтер тізбегі және кейбір химиялық модификациялар) жылдам оқуда біз әлдеқайда жақсырақ болдық.

жасалады

оған), біз әлі де барлық ақпаратты және оны жүзеге асыратын барлық механизмдерді сенімді түрде декодтауды білмейміз.

оқылады

және ақыр соңында білдірді.

Дегенмен, негізгі қадамдары генетикалық кодты оқуға және көрсетуге байланысты кейбір негізгі принциптер мен механизмдер бар.

түсініледі

және бұл барлық биологтар үшін тұжырымдамалық құралдар жинағының бөлігі болуы керек. Осы процестердің екеуі – транскрипция және трансляция, олар ДНҚ-да жазылған генетикалық код бөліктерін байланысты полимер РНҚ молекулаларына айналдыру және сәйкесінше РНҚ кодын ақуыздарға оқу және кодтау.

BIS2A-да біз түсінуді дамытуға назар аударамыз

процесс

транскрипция (Энергия тарихы процесті сипаттайтын айдар екенін еске түсіріңіз) және оның генетикалық ақпаратты білдірудегі рөлі. Біз транскрипцияны талқылауды функционалдық мәселелерге (мәселелерді шешу/дизайн мәселелері рубрикасының бөліктерін енгізу) назар аудару арқылы ынталандырамыз.

шешілсін

орын алатын процесс. Содан кейін біз процесті сипаттаймыз

пайдаланылады

Табиғат арқылы әртүрлі функционалды РНҚ молекулаларын (әртүрлі құрылымдық, каталитикалық немесе реттеуші рөлдері болуы мүмкін) жасау үшін, соның ішінде хабаршы РНҚ (

мРНҚ

) ақуыздарды синтездеу үшін қажетті ақпаратты тасымалдайтын молекулалар. Сол сияқты, біз трансляция процесіне, рибосомалардың ақуыздарды синтездеу процесіне байланысты қиындықтар мен сұрақтарға назар аударамыз.

Біз көбінесе биологиялық жүйелердегі генетикалық ақпараттың негізгі ағынын «орталық догма» деп аталатын схемада бейнелейміз (төмендегі суретті қараңыз). Бұл схема ДНҚ-да кодталған ақпарат транскрипция арқылы РНҚ-ға ағып, ақырында белоктарға ауысатынын айтады. Кері транскрипция (ДНҚ және РНҚ үлгісін жасау) және репликация сияқты процестер де ақпаратты әртүрлі формаларда тарату механизмдерін білдіреді. Алайда бұл схема ақпараттың қалай болатыны туралы ештеңе айтпайдыкодталғаннемесе модельде бейнеленген молекула түрлерінің әртүрлі қабаттары арасында реттеуші сигналдар қозғалатын механизмдер туралы. Сондықтан, төмендегі схема кез келген биологтың лексиконының қажетті бөлігі болып табылады, мүмкін, қалғанескідәстүр бойынша студенттер ақпарат ағынының тетіктері күрделірек екенін білуі керек (кейбіреулері туралы біз барған сайын білетін боламыз және «орталық догма» тек кейбір негізгі жолдарды білдіреді).

1-сурет. Генетикалық ақпарат ағыны.
Атрибуция:Марк Т. Facciotti (түпнұсқа жұмыс)

Генотиптен фенотипке

Келесі бөлімдердегі маңызды түсінік генетикалық ақпарат арасындағы байланыс болып табылады генотип, және оны білдірудің нәтижесі, the фенотип. Бұл екі термин мен екеуін байланыстыратын тетіктер ерік-жігерталқыланадыкелесі бірнеше апта ішінде қайта-қайта - осы сөздік қорын қолдануды үйрене бастаңыз.

2-сурет. ДНҚ-да болатын ақпаратбілдірутранскрипция арқылысақталадыжеке нуклеотидтер тізбегінде 5' - 3' бағытта оқылады. Ақпаратты ДНҚ-дан РНҚ-ға түрлендіру (транскрипция деп аталатын процесс) бұл ақпаратты сол күйінде жұмыс істей алатын уақытша көшірмеге көрсетеді (мысалы,тРНҚ,рРНҚ) немесе ақуызды құруға қажетті ақпаратты кодтайтын хабарлама (мысалы,мРНҚ). Жасушалар пайдаланадымРНҚаударма арқылы ақуыздарды жасау үлгісі ретінде. Мұнда біз екі түрлі ДНҚ тізбегін көрсетеміз. Әрбір ДНҚ тізбегіндегі айырмашылықтар екі түрлі түзілуіне әкеледімРНҚ, одан кейін екі түрлі ақуыздың синтезі. Сайып келгенде, бұл әртүрлі ақуыздар тышқандарда екі түрлі пальто түсін жасайды.

Генотип организмнің ДНҚ-да сақталған ақпаратты, нуклеотидтердің тізбегін және оның гендерінің жинақталуын білдіреді. Фенотип биіктігі, салмағы, өндірілген АТФ мөлшері, лактозаны метаболиздеу қабілеті және қоршаған ортаны ынталандыру реакциясы сияқты өлшеуге болатын кез келген физикалық сипаттаманы білдіреді. Генотиптегі айырмашылықтар, тіптішамалы, табиғи сұрыпталуға ұшырайтын әртүрлі фенотиптерге әкелуі мүмкін. Жоғарыдағы сурет осы идеяны бейнелейді. Сондай-ақ, біз классикалық түрде генотип пен фенотиптің қарым-қатынасы туралы сөйлескен кезде ескеріңізконтексткөпжасушалы организмдер, бұл номенклатура және негізгі ұғымдар барлық организмдерге, тіпті бактериялар мен археялар сияқты бір жасушалы организмдерге де қатысты.

Гендер

Ген дегеніміз не? А ген функционалды РНҚ кодтайтын ағза геномындағы ДНҚ сегменті (мысалы,

рРНҚ

,

тРНҚ

,

т.б

.)

немесе

ақуыз өнімі (ферменттер, тубулин және т.б.). Жалпы ген реттеуші аймақтарды кодтайтын элементтерді және транскрипцияланған бірлікті кодтайтын аймақты қамтиды.

Гендер алуы мүмкін мутациялар— нуклеотидтердің құрамындағы және немесе тізбегіндегі — кодтау немесе реттеу аймақтарындағы өзгерістер ретінде анықталады. Бұл мутациялар бірнеше нәтижеге әкелуі мүмкін: (1) нәтижесінде өлшенетін ештеңе болмайды; (2) ген енді экспрессияланбайды; немесе (3) ген өнімінің экспрессиясы немесе мінез-құлқы

(

с) әртүрлі. Бірдей бөлісетін организмдер популяциясында

ген

геннің әртүрлі нұсқалары

белгілі

ретінде аллельдер. Әртүрлі аллельдер жеке адамдардың фенотиптеріндегі айырмашылықтарға әкелуі мүмкін және селективті қысым астында биологияның әртүрлілігіне ықпал етеді.

Осы сөздік терминдер мен байланысты ұғымдарды үйренуді бастаңыз. Сонда сіз боласыз

біршама

олармен келесі дәрістерде толығырақ танысқанда таныс боламыз.

3-сурет. ГентұрадыРНҚ немесе ақуыз өнімі үшін оның реттеуші аймақтарымен бірге жүретін кодтау аймағы.Кодтау аймағы транскрипцияланадыішінеРНҚқайкейін аударыладыақуызға айналады.

ДНҚ-дан РНҚ-ға транскрипция

Бөлімнің қысқаша мазмұны

Бактериялар, археялар және эукариоттардың барлығы геномдарынан гендерді транскрипциялауы керек. Жасушаның орналасуы әртүрлі болуы мүмкін болса да (эукариоттар ядрода транскрипцияны жүзеге асырады; бактериялар мен архейлер цитоплазмада транскрипцияны орындайды), осы кластардың әрқайсысының ағзалары бұл процесті жүзеге асыратын механизмдер:түбегейлібірдей және мүмкінсипатталадыүш кезеңнен тұрады: инициация, созылу және аяқталу.

Қысқатранскрипцияға шолу

Транскрипция – бұлпроцесіДНҚ сегментінің РНҚ көшірмесін жасау. Өйткені бұл а процесс, біз транскрипцияның функционалды түсінігін дамыту үшін Energy Story айдарын қолданғымыз келеді. Транскрипция басталғанға дейін молекулалар жүйесі қалай көрінеді? Соңында ол қандай көрінеді? Транскрипция кезінде заттың қандай түрленуі және энергияның тасымалдануы жүреді және процесті не катализдейді? Біз сондай-ақ процесс туралы ойланғымыз келедіДизайн сыныбыкөзқарас. Егер биологиялық тапсырма РНҚ-ның химиялық тілінде ДНҚ көшірмесін жасау болса, нуклеотидті полимерлердің басқа процестері туралы білімімізді ескере отырып, біз қандай қиындықтарды орынды болжауға немесе күтуге боладыжеңу? Табиғат бұл мәселелерді әртүрлі тәсілдермен шешкеніне дәлел бар ма? Транскрипцияның сәттілігінің критерийлері қандай болып көрінеді? Сіз идеяны түсінесіз.

Транскрипцияға қойылатын кейбір негізгі талаптардың тізімі

Алдымен біздің кейбір негізгі білімімізді пайдалана отырып және егер мақсат қос тізбекті ДНҚ молекуласының бір тізбегінің РНҚ көшірмесін жасау болса, транскрипция кезінде не болуы мүмкін екенін елестету арқылы тапсырмаларды қарастырайық. Кейбір негізгі логиканы пайдалану бізге көптеген маңызды сұрақтар мен білуіміз керек нәрселер туралы қорытынды жасауға мүмкіндік беретінін көреміз

қалпында

процесті дұрыс сипаттау.

Біз дизайн жасағымыз келетінін елестетіп көрейік

наномашина

/нанобот, ол транскрипцияны жүргізеді. Кейбірін пайдалана аламыз

Дизайн сыныбы

қажет проблемалар мен ішкі мәселелерді анықтау үшін ойлау

шешілсін

біздің кішкентай робот арқылы.

• Машинаны қай жерден бастау керек? Миллиондаған және миллиардтаған негізгі жұптардың қатарында машина қайда болуы керек

бағытталу

?
• Машина қай жерде тоқтауы керек?
• Егер бізде іске қосу және тоқтату сайттары болса, бізге бұл ақпаратты кодтау жолдары қажет болады, осылайша біздің машинамыз

(

с) бұл ақпаратты оқи алады - бұл қалай болады

орындалу

?
• ДНҚ-ның қанша РНҚ көшірмесін жасауымыз керек?
• РНҚ көшірмелері қаншалықты жылдам болуы керек

жасалуы

?
• Көшірмелер қаншалықты дәл болуы керек

жасалуы

?
• Процесс қанша энергия алады және энергия қайдан келеді?

Бұл тек кейбір негізгі сұрақтар. Қаласа тереңірек қазуға болады. Дегенмен, бұл процесс бізге жақсы әсер ету үшін жеткілікті. Назар аударыңыз, бұл сұрақтардың көпшілігі ДНҚ репликациясын түсіну үшін қажет болуы мүмкін деп ойлаған сұрақтарға өте ұқсас.

Транскрипцияның құрылыс блоктары

РНҚ-ның құрылыс блоктары

Нуклеотидтердің құрылымы туралы пікірталасымызда РНҚ-ның құрылыс блоктары ДНҚ-ға өте ұқсас екенін еске түсірейік. РНҚ-да құрылыс блоктары нуклеотидтрифосфаттардан тұрадықұрастырыладырибоза қантының, азотты негіздің және үш фосфат тобының. ДНҚ құрылыс блоктары мен РНҚ арасындағы негізгі айырмашылықтар мынадаРНҚ молекулалары тұрадырибоза қанттары бар нуклеотидтерді (дезоксирибоза қанттарынан айырмашылығы) және нуклеотиді бар уридинді (ДНҚ-дағы тимидинге қарағанда) қолданыңыз. Төменде урацил мен тиминнің құрылымдық жағынан өте ұқсас екенін ескеріңіз - урацилге тек метил (CH) жетіспейді.3) тиминмен салыстырғанда функционалдық топ.

1-сурет. Нуклеотидтердің негізгі химиялық компоненттері.
Атрибуция:Марк Т. Facciotti (түпнұсқа жұмыс)

Транскрипцияны бастау

Промоутерлер

Белгілі бір ДНҚ бөлігінің РНҚ көшірмесін жасауға жауапты белоктар (транскрипция) алдымен элементтің басталуын тани білуі керек.көшіріледі. А промоутер ДНҚ тізбегі, оған транскрипция механизмі деп аталатын әртүрлі ақуыздар байланысады және транскрипцияны бастайды. Көп жағдайда промоторлар реттейтін гендердің жоғары ағынында (кодтау аймағына 5') болады. Промотордың нақты тізбегі өте маңызды, өйткені ол жасуша геннің сәйкес кодтау бөлігін үнемі, кейде немесе сирек транскрипциялайтынын анықтайды. Промоторлар түрлер арасында әртүрлі болғанымен, ұқсас тізбектердің бірнеше элементтерікейде сақталады. бойынша-10және-35инициация алаңының жоғары жағындағы аймақтар, екеуі барпромоутерконсенсус көптеген промоторлардағы және әртүрлі түрлердегі ұқсас тізбектер немесе аймақтар. Кейбір промоутерлердің консенсус тізбегіне өте ұқсас бірізділігі болады (ең көп таралған тізбек элементтері бар реттілік), ал басқалары мүлдем басқаша көрінеді. Бұл реттілік вариациялары транскрипцияны бастау үшін транскрипциялық аппараттың промотормен байланыса алатын күшіне әсер етеді. Бұл транскрипттердің санын бақылауға көмектеседіжасаладыжәне олар қаншалықты жиі жасалады.

2-сурет. а) Геннің жалпы диаграммасы. Генге промоторлар тізбегі, трансляцияланбаған аймақ (UTR) және кодтау тізбегі кіреді. (б) Бірнеше күшті ішек таяқшаларының тізіміпромоутертізбектер. -35 қорап және -10 қорапжоғары деңгейде сақталғанкүшті промоутерлер тізіміндегі тізбектер. Әлсіз промоторлар осы тізбектермен салыстырғанда негізгі жұптық айырмашылықтарға ие болады.
Дереккөз: http://www.discoveryandinnovation.co...lecture12.html

Бактериялық және эукариоттық промоторлар

Бактериялық жасушаларда -10 аймағы деп аталатын -10 консенсус тізбегі AT бай, көбінесе TATAAT. -35 тізбегі, TTGACA,

танылады

және белокпен байланысады σ. Бірде бұл ақуыз-ДНҚ өзара әрекеттесу

жасалады

, ядро ​​РНҚ полимеразасының суббірліктері сайтпен байланысады. AT ассоциацияларының тұрақтылығы салыстырмалы түрде төмен болғандықтан, AT-қа бай -10 аймағы ДНҚ шаблонын ашуды жеңілдетеді және

бірнешефосфодиэфироблигациялар жасалады

.

Эукариоттық промоторлар прокариоттық промоторларға қарағанда әлдеқайда үлкен және күрделірек, бірақ екеуінде де AT-ға бай аймақ бар — эукариоттарда ол

әдетте деп аталады

TATA қорабы. Мысалы, тышқанның тимидинкиназа генінде,

TATA қорабы орналасқан

сағ

шамамен -30

. Бұл ген үшін TATA қорапшасының дәл тізбегі TATAAAA болып табылады.

үлгі емес

жіп. Бұл реттілік келесімен бірдей емес E. coli -10 аймақ, бірақ екеуінің де сапасы ортақ

болу

AT-қа бай элемент.

Бір бактериялық полимеразаның орнына көптеген эукариоттардың геномдары әрқайсысы он немесе одан да көп белок суббірліктерінен тұратын үш түрлі РНҚ полимеразаларды кодтайды. Әрбір эукариоттық полимераза белгілі белоктардың белгілі бір жиынтығын қажет етеді транскрипция факторлары оны промоутерге жалдау. Сонымен қатар, басқа транскрипция факторларының армиясы, күшейткіштер деп аталатын ақуыздар және дыбыс өшіргіштер әр промотордан РНҚ синтезін реттеуге көмектеседі. Күшейткіштер мен дыбыс өшіргіштер транскрипцияның тиімділігіне әсер етеді, бірақ

қажет емес

транскрипцияны немесе оның үрдісін бастау үшін. А-ның қалыптасуында базальды транскрипция факторлары шешуші рөл атқарады алдын ала бастау кешені кейіннен транскрипцияны бастау үшін РНҚ полимеразаны тартатын ДНҚ үлгісінде.

Транскрипцияның басталуы РНҚ-полимеразамен байланысуынан басталады промоутер. Транскрипция ДНҚ қос спиралын қажет етедіішінара босаңсу үшінбір жіп жасай алатындайретінде пайдаланыладыРНҚ синтезінің үлгісі. Босану аймағыаталадыа транскрипция көпіршігі.

3-сурет. Элонгация кезінде РНҚ полимераза ДНҚ шаблонының бойымен жүреді, синтездейдімРНҚ5'-ден 3' бағытында, содан кейін ДНҚ-ны сол күйінде айналдырадыоқылады.

Ұзарту

Транскрипция әрқашан келесіден басталады шаблон тізбегі, қос тізбекті ДНҚ-ның екі тізбегінің бірі. РНҚ өнімі шаблон тізбегіне қосымша болып табылады және оған ұқсас дерлікүлгі емесжіп деп аталады кодтау тізбегі, РНҚ-да ДНҚ-да кездесетін тиминнің (Т) орнына урацил (U) болатынын қоспағанда. Элонгация кезінде фермент шақырылады РНҚ полимераза ДНҚ шаблонының бойымен нуклеотидтерді ДНҚ репликациясына ұқсас жолмен ДНҚ үлгісімен жұптастыру арқылы қосады, айырмашылығы РНҚ тізбегі болып табылады.синтезделедіДНҚ үлгісімен байланыспайды. Ұзару жүріп жатқанда ДНҚүздіксіз шешіледінегізгі ферменттің алдында және оның артына оралады. Синтез бағыты оның бағытымен бірдей екенін ескеріңізsyntheәпкеДНҚ-да — 5' - 3'.

4-сурет. Элонгация кезінде РНҚ-полимераза ДНҚ шаблонының бойымен қадағалап, синтездейдімРНҚ5'-ден 3' бағытында, ДНҚ-ны ағытып, сосын кері айналдырадыоқылады.

5-сурет. Транскрипция процесінде нуклеотидтердің қосылуы нуклеотидтердің қосылуына өте ұқсасжылыДНҚ репликациясы. РНҚполимерленеді5'-ден 3'-ге дейін және әрбір нуклеотид қосылғанда, афосфоангидридбайланыс болып табыладыгидролизденгенферменттің әсерінен полимер ұзағырақ болады және екі бейорганикалық фосфат бөлінеді.
Дереккөз: http://utminers.utep.edu/rwebb/html/...аңсау.html

Бактериялық және эукариоттық ұзару

Бактерияларда ұзару оның бөлінуінен басталады σ полимеразаның суббірлігі. диссоциациясы σ өзек ферментіне ДНҚ үлгісі бойынша синтездеуге мүмкіндік береді

мРНҚ

секундына шамамен 40 нуклеотид жылдамдығымен 5'-3' бағытында. Ұзару жүріп жатқанда ДНҚ

үздіксіз шешіледі

негізгі ферменттің алдында және оның артына оралады. ДНҚ мен РНҚ арасындағы негіздің жұптасуы оның тұрақтылығын сақтау үшін жеткілікті тұрақты емес

мРНҚ

синтез компоненттері. Оның орнына, РНҚ полимераза ДНҚ үлгісі мен жаңадан пайда болған РНҚ тізбектері арасында тұрақты байланыстырушы ретінде әрекет етеді, бұл ұзаруды қамтамасыз етеді.

үзілмейді

мерзімінен бұрын.

Эукариоттарда полимеразаның алдын ала бастау кешені түзілгеннен кейін

шығарылады

басқа транскрипция факторларынан және

ұзартуға рұқсат етіледі

Прокариоттардағыдай полимераза синтезделуін жалғастырады

пре-мРНҚ

5' - 3' бағытында. Бұрын талқыланғандай, РНҚ полимераза II эукариоттық гендердің негізгі үлесін транскрипциялайды, сондықтан бұл бөлімде бұл полимераза ұзару мен аяқталуды қалай жүзеге асыратынына назар аударылады.


Мүмкін NB талқылауы Нүкте

ДНҚ репликациясының инициациясының энергетикалық тарихын + транскрипцияның инициациясының энергетикалық тарихын + ұзартуын салыстырыңыз және салыстырыңыз.


Тоқтату

Бактерияларда

Бір рет ген

транскрипцияланады

, бактериялық полимераза ДНҚ үлгісінен ажырап, жаңадан жасалған

мРНҚ

. Транскрипцияланатын генге байланысты тоқтату сигналдарының екі түрі бар. Біреуі

а

белок негізіндегі, ал екіншісі РНҚ негізіндегі. Rho-тәуелді аяқталу

бақыланады

бойынша

rho

өсуде полимеразаны қадағалайтын ақуыз

мРНҚ

шынжыр. Геннің соңына таман полимераза ДНҚ шаблонында G нуклеотидтерінің ағынымен кездеседі және ол тоқтап қалады. Нәтижесінде,

rho

ақуыз полимеразамен соқтығысады. rho-мен әрекеттесу оны шығарады

мРНҚ

транскрипция көпіршігінен.

Rho-тәуелсіз тоқтату

бақыланады

ДНҚ шаблон тізбегіндегі белгілі бір реттілікпен. Полимераза транскрипцияланатын геннің соңына жақындаған кезде ол CG нуклеотидтеріне бай аймаққа тап болады. The

мРНҚ

өзіне қайта оралып, комплементарлы CG нуклеотидтері байланысады

бірге

. Нәтижесі тұрақты шаш қыстырғыш бұл полимеразаның тоқтап қалуына әкеледі

транскрипциялай бастайды

AT нуклеотидтеріне бай аймақ. Бірін-бірі толықтыратын UA аймағы

мРНҚ

транскрипт ДНҚ шаблонымен әлсіз әрекеттесуді ғана құрайды. Бұл тоқтап қалған полимеразамен бірге негізгі ферменттің ыдырауы және жаңасын босатуы үшін жеткілікті тұрақсыздықты тудырады.

мРНҚ

транскрипт.

Эукариоттарда

Түрлі полимеразалар үшін транскрипцияның аяқталуы әртүрлі. Прокариоттардан айырмашылығы, эукариоттарда РНҚ-полимераза II арқылы ұзару жүреді1,000– транскрипцияланатын геннің соңынан тыс 2000 нуклеотид. Бұл алдын аламРНҚқұйрықкейін жойыладыкезінде бөліну арқылымРНҚөңдеу.Екінші жағынан, РНҚI және III полимеразалар тоқтату сигналдарын қажет етеді. РНҚ-полимераза I арқылы транскрипцияланған гендер арнайы 18 нуклеотидті тізбекті қамтидытаныладытерминалдық ақуыз арқылы. РНҚ-полимераза III-те аяқталу процесі амРНҚұқсас шаш қыстырғышыдейінпрокариоттардағы транскрипцияның rho-тәуелсіз аяқталуы.

Архейде

Архейдегі транскрипцияның аяқталуы өмірдің басқа екі саласына қарағанда әлдеқайда аз зерттелген жәнеәлі де жақсы түсінілмеген. Функционалдық бөлшектері бар механизмдерге ұқсас болуы мүмкінкөріндіөмірдің басқа салаларында егжей-тегжейлі мәліметтер жоқауқымыбұл курс.

Ұялы орналасу

Бактерияларда және архейлерде

Бактериялар мен археяларда транскрипцияда жүредіцитоплазма,ДНҚ қайдаорналасқан. Өйткені ДНҚ-ның орналасуы, осылайша транскрипция процесі,физикалық тұрғыдан бөлінбейдіұяшықтың қалған бөлігінен транскрипция аяқталмай тұрып трансляция жиі басталады. Бұл дегенімізмРНҚбактерияларда жәнеархейпайдаланыладыақуыздың үлгісі ретінде ол толығымен өндірілмейдімРНҚ. Кеңістіктік сегрегацияның жоқтығы сонымен қатар бұл процестер үшін уақытша сегрегацияның өте аз екенін білдіреді. 6-суретте бір мезгілде болатын транскрипция мен трансляция процестері көрсетілген.

6-сурет. Транскрипция процесінде нуклеотидтердің қосылуы нуклеотидтердің қосылуына өте ұқсасжылыДНҚ репликациясы.
Дереккөз:Марк Т. Факчотти (өз жұмысы)

Эукариоттарда....

Эукариоттарда транскрипция процесіфизикалық тұрғыдан бөлінгенжасушаның қалған бөлігінен, ядроның ішінде секвестрленген. Бұл екі нәрсеге әкеледі:theмРНҚаяқталдыАударма басталғанға дейін және оны «түзетуге» немесе «өңдеуге» уақыт бармРНҚаударма басталғанға дейін. Бұл процестердің физикалық бөлінуі эукариоттарды өзгертуге мүмкіндік бередімРНҚқызмет ету мерзімін ұзарту үшінмРНҚнемесе тіпті ақуыз өнімін өзгертедіөндіріледібастапмРНҚ.

МРНҚөңдеу

5' G-қақпағы және 3' поли-А құйрығы

Қашанэукариоттықгентранскрипцияланады, жасуша ядродағы бастапқы транскриптті бірнеше жолмен өңдейді. Эукариоттық жасушаларөзгертумРНҚ3' соңында поли-А құйрығын қосу арқылы. Бұл А қалдығының жұмысықосыладыгеномдық ДНҚ-ны үлгі ретінде пайдаланбайтын фермент арқылы. TheмРНҚ5' ұшының химиялық модификациясы бар, 5'-қақпақ деп аталады. Деректер бұл түрлендірулердің екеуі де қызмет ету мерзімін ұзартуға көмектесетінін көрсетедімРНҚ(цитоплазмада оның мерзімінен бұрын ыдырауын болдырмау) және көмектесумРНҚаударуды бастау.

7-сурет. алдын аламРНҚөңделедіқадамдар қатарында.Интрондаржойылады, 5' қалпақшасы және поли-А құйрығықосылады.
Дереккөз: http://www.discoveryandinnovation.co...lecture12.html

Мүмкін NB талқылауы Нүкте

Транскриптомика - бұл организмді немесе популяцияның транскриптомын немесе барлық РНҚ молекулаларының толық жиынтығын зерттеуді қамтитын «-омиканың» бөлімі. Транскриптомды(ларды) зерттеуден қандай ақпарат алуға болады? Транскриптомиялық талдау шешуге көмектесетін қандай да бір керемет ғылыми сұрақтарды ойлай аласыз ба? Транскриптомиялық тәсілдерге қандай шектеулер бар, олар талдауларды жүргізу кезінде есте ұстай алады?


Альтернативті қосу

Қосылу эукариоттардың көпшілігінде боладымРНҚқай интрондардажойыладыбастапмРНҚреттілік және экзондарбайланғанбірге. Бұл әлдеқайда қысқа жасай аладымРНҚбастапқы транскрипцияға қарағанда. Қосылу жасушалардың араласуына және сәйкес келуіне мүмкіндік бередіқайэкзондаренгізілгенфиналғамРНҚөнім. Төмендегі суретте көрсетілгендей, бұл бірнеше белоктардың бір генмен кодталуына әкелуі мүмкін.

8-сурет. ДНҚ-да сақталған ақпарат шектеулі.Кейбір жағдайларда, организмдер әртүрлі соңғы өнімдерді жасау үшін осы ақпаратты араластыра алады. Эукариоттарда альтернативті сплайсинг әртүрлі құруға мүмкіндік бередімРНҚөнімдер, олкезек бойыншапайдаланыладыаудармада әртүрлі белок тізбегін жасау үшін. Бұл, сайып келгенде, әртүрлі белок пішіндерін өндіруге, осылайша әртүрлі ақуыз функцияларына әкеледі.
Дереккөз: http://www.discoveryandinnovation.co...lecture12.html


Кітаптарды шолу

Статистикалық оқытуға кіріспе соңғы жиырма жылда биологиядан қаржыға, маркетингке дейін астрофизикаға дейінгі салаларда пайда болған ауқымды және күрделі деректер жиынтығын түсінуге арналған маңызды құралдар жиынтығы болып табылатын статистикалық оқыту саласына қол жетімді шолуды ұсынады. Бұл кітап сәйкес қолданбалармен бірге ең маңызды модельдеу және болжау әдістерінің кейбірін ұсынады. Тақырыптарға сызықтық регрессия, классификация, қайта іріктеу әдістері, кішірейту тәсілдері, ағашқа негізделген әдістер, тірек векторлық машиналар, кластерлеу және т.б. кіреді. Ұсынылған әдістерді көрсету үшін түрлі-түсті графика және нақты мысалдар пайдаланылады. Бұл оқу құралының мақсаты ғылымда, өндірісте және басқа салаларда практиктердің осы статистикалық оқыту әдістерін пайдалануын жеңілдету болғандықтан, әр тарауда өте танымал ашық бастапқы статистикалық бағдарламалық платформа болып табылатын R-де ұсынылған талдаулар мен әдістерді енгізу бойынша оқу құралы бар. . Авторлардың екеуі статистика мен машиналық оқытуды зерттеушілерге арналған танымал анықтамалық «Статистикалық оқыту элементтерін» (Хасти, Тибширани және Фридман, 2-ші басылым 2009) бірлесіп жазған. Статистикалық оқытуға кіріспе көптеген бірдей тақырыптарды қамтиды, бірақ әлдеқайда кеңірек аудиторияға қолжетімді деңгейде. Бұл кітап өз деректерін талдау үшін статистикалық оқытудың алдыңғы қатарлы әдістерін пайдаланғысы келетін статистиктерге де, статистикалық еместерге де арналған. Мәтін тек алдыңғы сызықтық регрессия курсын және матрицалық алгебраны білмеуді болжайды.


Қол жеткізу опциялары

1 жылға толық журналға қол жеткізіңіз

Барлық бағалар NET бағалары болып табылады.
ҚҚС кейінірек кассада қосылады.
Салықты есептеу тексеру кезінде аяқталады.

ReadCube қолданбасында шектеулі уақытқа немесе толық мақалаға қол жеткізіңіз.

Барлық бағалар NET бағалары болып табылады.


АЛҒЫС

Бұл жұмыс Өсімдіктердің геномын зерттеу ұлттық институтының және Ғылым және технология департаментінің негізгі гранты-SERB үшін AP-ға стартап зерттеу гранты арқылы қолдау тапты. MT Биотехнология департаментіне алғыс, Үкімет. Үндістанның Рамалингасвами стипендиаты (грант № BT/HRD/35/02/2006) түріндегі көмекті қаржыландыру үшін. PKT биотехнология департаментіне, Нью-Делиге TATA Innovation Fellowship түрінде қаржылық қолдау көрсеткені үшін алғысын білдіреді. Авторлар DBT-eLibrary консорциумына (DeLCON) электрондық ресурстарға қол жеткізуді қамтамасыз еткені үшін алғыс білдіреді.